Un "proton wire" pour permettre la formation de liaisons peptidiques

Polikanov, Y.S., Steitz, T.A., Innis, C.A. (2014). A proton wire to couple aminoacyl-tRNA accommodation and peptide-bond formation on the ribosome. Nat Struct Mol Biol 21, 787-793.

PDB : 1VY4, 1VY5, 1VY6, 1VY7

Les structures cristallines des complexes pré-attaque et post-catalyse du ribosome 70S de Thermus thermophilus révèlent un réseau de liaisons hydrogène le long duquel le transfert de protons pourrait avoir lieu pendant la formation de la liaison peptidique. Nous proposons un modèle de « proton wire » pour la formation des liaisons peptidiques, dans lequel le ribosome et l'ARNt du site A facilitent la déprotonation de l'α-amine d'un aminoacyl-ARNt entrant par l'activation d'une molécule d'eau.