innis lab
Qui nous sommes
Nous sommes une équipe interdisciplinaire à la croisée de la biologie structurale, de la biochimie, de la biologie moléculaire et de la microbiologie. Notre expertise diversifiée nous permet d'aborder des questions biologiques complexes sous des angles complémentaires. Nous développons de nouveaux outils pour étudier les processus biomoléculaires à haut débit ou pour concevoir des biomolécules destinées à des applications thérapeutiques.
Notre groupe fait partie du Laboratoire ARNA, une unité mixte de recherche Inserm (U1212) – CNRS (UMR5320) hébergée par l'Université de Bordeaux et axée sur la biologie et la chimie des acides nucléiques.
Nous sommes situés dans le nouveau bâtiment Bordeaux Biologie Santé (BBS), à proximité du centre historique de la ville de Bordeaux, dans le sud-ouest de la France.
Le labo en 2025 | De gauche à droite : Fanny B., Lélaud E., Mélanie G., Anne B., Axel I., Arunima B., Dorian G. et Thibaud R.
Actualités
Nos thématiques
Synthèse protéique bactérienne
Les ribosomes sont les grands complexes macromoléculaires responsables de la traduction de l'information génétique contenue dans l'ARN messager en protéines.
Nous étudions comment les ribosomes bactériens fabriquent des protéines, comment les peptides d'arrêt transforment les ribosomes qui les synthétisent en capteurs de petites molécules pour permettre l'adaptation bactérienne, et comment les antibiotiques et les peptides antimicrobiens bloquent ces machines moléculaires complexes.
Découvrez nos molécules préférées ci-dessous !
Ribosome 70S d'E. coli
(PDB 6TC3)
Surveillent l'environnement cellulaire
Ces courtes séquences conservées d'acides aminés ont une capacité unique : bloquer la traduction en bloquant le ribosome qui les produit... de l'intérieur.
Certains peptides d’arrêt fonctionnent comme des capteurs de petites molécules et peuvent reprogrammer les ribosomes pour détecter des antibiotiques, des acides aminés ou d’autres métabolites !
Neutralisent ou tuent les bactéries nocives
Ces petites molécules structurellement et chimiquement diverses sont le pilier de la médecine moderne, mais leur efficacité est menacée par des agents pathogènes multirésistants.
Aidez-nous à comprendre comment ils fonctionnent et comment contourner les mécanismes de résistance des bactéries !
Protégent contre les envahisseurs bactériens
Omniprésents dans la nature, ces composants de l’immunité innée peuvent parfois cibler les ribosomes de bactéries nocives pour empêcher la propagation des infections.
Et comme ils sont également fabriqués par le ribosome, nous pouvons l’utiliser comme plateforme de production et de sélection pour développer des antimicrobiens de nouvelle génération !
Sécrétion de protéines bactériennes
Outre le ribosome, les bactéries abritent une variété de nanomachines complexes, telles que des systèmes de sécrétion spécialisés.
Nous nous sommes récemment lancés dans l’étude des systèmes de sécrétion de type III et de la manière dont ils peuvent être réutilisés pour la production de protéines pour des applications biomédicales.
Notre approche
Afin de comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents, nous nous appuyons sur une combinaison de biologie moléculaire et structurale (cryo-EM), de biochimie, de génétique microbienne et de bioinformatique.
De plus, nous utilisons le séquençage massif et la microfluidique en gouttes pour développer de nouvelles méthodes de caractérisation fonctionnelle et de criblage de peptides à haut débit.
L’un des principaux objectifs de notre laboratoire dans les années à venir sera d’exploiter ces outils pour développer de nouveaux peptides antimicrobiens pour lutter contre les agents pathogènes résistants aux antibiotiques, des capteurs de petites molécules pour la biologie de synthése ou des bactéries modifiées pour des applications biomédicales.
Où nous trouver
Equipe Innis – Laboratoire ARNA
Bâtiment BBS, Université de Bordeaux
Campus Carreire
2, Rue Dr Hoffmann Martinot
33000 Bordeaux, FRANCE
Nous remercions les organismes de financement qui financent nos recherches
RibioTiX (ANR-22-CE11-0012)
BactCellFactory (ANR-23-CE18-0047)
RiboStallRescue (ANR-25-CE12)