Bac-7, un PrAMP issu de mammifère, bloque le ribosome.

Seefeldt, A.C., Graf, M., Nguyen, F., Pérébaskine, N., Arenz, S., Mardirossian, M., Scocchi, M., Wilson, D.N., Innis, C.A. (2016). Structure of the mammalian antimicrobial peptide Bac7(1-16) bound within the exit tunnel of a bacterial ribosome. Nucleic Acids Res. 44, 2429-2438.

PDB : 5F8K, 5FDU, 5FDV

Nous présentons les structures cristallines du ribosome 70S de Thermus thermophilus en complexe avec les 16 premiers résidus de la bacténécine-7 bovine (Bac7) (5F8K), ainsi que de PrAMP dérivés d'insectes, la pyrrhocoricine (5FDV) et metalnikowine (5FDU). Nous montrons en outre que Bac7 et Onc112 entrent en compétition avec l'érythromycine pour se lier au tunnel de sortie du polypeptide naissant du ribosome et que, à l'instar d'Onc112, Bac7 permet la formation du complexe d'initiation mais empêche les ribosomes de passer à la phase d'élongation. Il est intéressant de noter que Bac7 cible également les ribosomes mammifères, ce qui explique pourquoi il doit être stocké sous forme de propeptide inactif à l'intérieur des neutrophiles qui le produisent.