La sparsomycine inhibe tous les ribosomes de manière identique

Paranjpe, M.N., Leroy, E.C., Syroegin, E.A., Flemmich, L., Thaler, J., Gillard, M., Bougas, A., Kournoutou, G., Dinos, G.P., Renault, T.T., Micura, R., Innis, C.A., Polikanov, Y.S. (2026). Sparsomycin inhibits translation through a conserved mechanism across all domains of life. Nucleic Acids Res.,54, gkag761.

On sait depuis des décennies que la sparsomycine bloque la synthèse protéique en se liant au centre peptidyl-transférase du ribosome. Cependant, la littérature structurale présentait une contradiction : cette molécule semblait se lier aux ribosomes bactériens d’une manière totalement différente de celle observée avec les ribosomes archéens et eucaryotes, ce qui est paradoxal compte tenu de la forte conservation de ce site catalytique. Dans cette étude collaborative avec les groupes Polikanov et Micura, nous combinons l’iTP-seq avec deux structures cristallographiques de ribosomes 70S de Thermus thermophilus , correspondant aux complexes d’initiation et d’élongation précoce, pour démontrer qu’une telle différence n’existe pas. Chez les bactéries, comme partout ailleurs, la sparsomycine s’insère dans le site A, bloquant l’extrémité CCA de l’ARNt du site P grâce à un réseau de liaisons hydrogène et empêchant physiquement l’insertion d’un aminoacyl-ARNt. Au-delà de la résolution d'une incohérence de longue date, nos travaux fournissent un point de départ structural concret pour la conception de dérivés de la sparsomycine plus sélectifs pour les ribosomes bactériens.